一般情况下，生物质锅炉热效率常常会收到料层厚度的影响。生物质锅炉热效率最高时的料层厚度通常需要控制在300mm左右，而且此时的料层厚度还要尽量保持不变。

当生物质锅炉的燃料着火燃烧稳定且在后拱区有一定明火燃烧时，可通过调节炉排各风门的开度来提高生物质锅炉热效率。生物质锅炉的风门开度调节一般需要前部风门开大，后部风门尽量关小。同时还要开启前后拱的二次风，二次风的风门开度大小视二次风开启后火床上方火焰及烟气流场而定。

另外，生物质锅炉的热效率要有保证，着火线还应控制在离引燃拱出口处得100～200mm范围内。着火过早，易引燃煤斗内燃料；过晚则不利于生物质锅炉燃料的燃尽。